Nel protocollo non viene previsto in modo chiaro ed espresso che gravi esclusivamente a carico dei bilanci aziendali il trattamento accessorio spettante ai professori e ai ricercatori universitari che svolgono attività assistenziale presso le Asui e gli altri enti del Ssr gravi esclusivamente a carico dei bilanci aziendali. Comportando il rischio che la relativa spesa vada a incidere sulle risorse destinate esclusivamente al finanziamento del trattamento economico fondamentale e accessorio della dirigenza medica e sanitaria.